一、幼魚的挑選孵化後的仔魚飼養20～30天，魚體長到3釐米左右時，開始進行挑選，去劣留優，強化生長速度，以達到保護性狀的目的。挑選幼魚是飼養過程中獲得優質錦鯉最重要的一個環節。一般在孵化後的3個多月期間內進行3～4次挑選。第1次挑選在仔魚孵出後的20～30天內進行，魚苗體長達到3釐米左右。主要是選留體質健壯，遊動活潑，脊柱筆直，各鰭無畸形或缺陷，品種特徵明顯的個體。
對其它個體淘汰掉或另行培育出售，但品種不同，其生長速度和形成斑紋的時間也不相同，所以品種特徵顯現時間也有早晚。例如：昭和三色錦鯉在孵化後15天左右開始顯現，黃金系錦鯉則在孵化後50天左右顯現。第2次挑選在第1次挑選後20天左右開始，選擇標準爲各鰭形狀是否優美，尤其胸鰭，頭形是否對稱，眼、吻、觸須是否變形，色彩是否鮮豔濃厚，圖案斑紋是否清晰，品種特徵是否明顯等。第3次挑選與第2次挑選間隔20天左右。
選擇標準：魚鰭大小比例要適宜，色彩鮮明，白底要純淨，不能有污點，紅斑要求邊緣清晰，黑斑要濃淡均勻，斑紋左右平衡，若在吻部及尾柄部有白色部分要清晰，品種特徵明顯等。第4次挑選與第3次基本相同。經過上述3～4次挑選，一般每尾魚所繁殖的後代中，最終符合要求的僅爲1000～3000尾或更少。錦鯉是大型魚，具有食用價值，經多次挑選淘汰出來的魚苗可以作食用魚飼養。
